3.8
84.5
2.非Bt的抗虫棉
6.3
132.7
5.7
125.5
0.2
4.7
3.常规棉
7.6
142.0
35.0
927.5
28.7
711.4
9418
8.0
153.0
37.5
960.3
35.8
864.5
其它
7.2
131.0
32.5
894.7
21.6
558.3
资料来源：同表1
期中，SGK321用药量最少，只有用药量最多的常规棉品种9418药量的1/3，常规棉和非Bt的抗虫棉的用药量和用药成本大于Bt抗虫棉，分别多用药3.3公斤和2公斤。中期是施药量和施药成本最多的时期，Bt抗虫棉表现出了极大的节药优势，常规棉的施药数量和施药成本分别是Bt抗虫棉的7倍和9倍。SGK321仍然是节药最多的品种，比常规棉品种9418少施药36公斤，少花费农药成本924元。说明在病虫害发生最严重的中期，它对害虫的防治效果好。
后期的农药施用较少，一方面是病虫害的危害减少，另一方面是植株的自身抵抗力增强，减少了病虫害的威胁。但一个值得注意的现象是施药量减少了，但施药成本却没有多大的降低，可能是因为施用在后期的农药价格较贵，农民因为对棉花最后的产量寄于厚望，舍得化钱购买质量好，价格高的农药来保障病虫害危害的降低和收成的提高。SGK321仍是施药数量和成本最少的品种，而常规棉仍然是农药数量和成本用的最多的品种，药量和成本分别是Bt抗虫棉的12倍和15倍。
虽然抗虫棉的种植总体上对农药起了相当大的替代作用，但各时期的农民施药仍然偏多，效果不是十分令人满意，主要是因为苗期抗虫棉对棉铃虫等鳞翅目幼虫抗性较强，有明显的致死作用，刺吸性害虫如红蜘蛛、蚜虫等数量加大上升为主要害虫。但生长缓慢造成后期既要进行营养生长又要进行生殖生长，棉株负担过重、组织老化，影响了转基因棉毒蛋白的表达。另一个原因可能是高温、高湿等生态环境对毒性基因的控制作用的限制也使棉花后期抗性下降( 崔金杰等，1998)。
2.肥料费用成本差异
从表2可以看出，Bt抗虫棉用肥数量较多，非Bt的抗虫棉用肥最少，而常规棉介于前两者之间。Bt抗虫棉用肥较多说明其植株生长旺盛，本身的后继营养跟不上生长的需要，需要大量自然界肥源作保证。
3.种子费用差异
抗虫棉种子用量显著低于常规棉,仅是常规棉的1/6～1/2（表2），主要是因为种子供应商对实际的产出以及考虑到棉花生长过程中对光线、植株叶片伸展程度的需要，而对棉花生产实行的严格数量管理。Bt抗虫棉种子使用量的节省，可以充分发挥棉花的生长势，增进了棉花的根系吸收营养，表现生长更强壮。Bt抗虫棉的种子成本高于常规棉种子成本，前者比后者每公顷高172元，主要的原因是Bt抗虫棉中的Bt基因包含着IPR（知识产权）的价格。非Bt的抗虫棉种子成本是常规棉2倍，主要的原因是统称为抗虫棉的种子都是较早时期种植的，那时的Bt抗虫棉还未大面积推广，其价格偏高。33B的种子成本高的主要原因是种子价格高。孟山都公司的种子在中国成功的进行了5年的商业运作，实现统一销价、统一供种、统一收购，零售价是42元/公斤，其中IPR价占42％。SGK321的价格与33B相近，欲于争夺河北种子市场，与外资公司竞争市场。GK-12在山东采取了较低的价格，以便及早占领山东这块大市场。常规棉的种子价格每公斤只有3元左右，这也是它们竞争种子市场、吸引农民的资本。
4.棉花用工及成本差异
抗虫棉与常规棉劳动用工每公顷相差120个工日。在农药用工中，常规棉的用工数量是抗虫棉的6倍。在所有调查样本中,SGK321的用工和农药用工成本最低，一方面说明植株自身的毒蛋白表达强烈，对害虫有极大杀伤作用，另一方面说明其植株健壮、抽枝齐整。
（二） 单产( 籽棉)的差异
从总体上看，Bt抗虫棉的单产略低于以9418品种为代表的常规棉，但差异不大。这是棉农忍受着棉铃虫的危害，依然不改初衷种植常规棉的主要原因，也是生物技术研究者仍然需艰苦探索的方向和目标，说明转基因技术远未成熟，预示着还有更大的潜力和发展空间。SGK321的单位面积产量为仅为2814公斤（表4），据说是由于播种时，种子没有及时到位，推迟了播种期以及部分棉农使用了种子公司陈年的棉种，苗期遇到了冷空气的影响以及出现出芽不整齐甚至不出芽的情况，造成部分棉农毁种，毁种平均花费100元/亩，虽采取一定措施但仍未达到满意效果，造成最后的收获产量下降。据中国农业科学院生物技术研究所研究人员介绍，该品种一般亩产应达到3750～4500公斤。表4还显示了作者调查样本中，抗虫棉和常规棉品种的单产稳定性状。其中33B差距较大，最高产量比最低产量高出近3.5倍，栽培差距较大，但标准差相对较低。GK系列产品高、低相差两倍多，表现出在一定程度上的稳定性。而9418品种高、低相差两倍，在形状表现上较稳定，据全国农业技术推广中心报道，1999年山东、河北是棉铃虫中等发生年，也在一定程度上减少了害虫对常规棉的危害。
表4.品种单位面积( 公顷)产量分析
品种
产量
(公斤/公顷)
标准差
最高产量
(公斤/公顷)
最低产量
(公斤/公顷)
Bt抗虫棉
33B
3439
530
5063
1530
SGK321
2814
532
4350
2250
GK-12
3495
582
4725
2250
其它
3419
579
4200
2250
非Bt的抗虫棉
2712
798
3750
1125
常规棉
3389
810
3180
1500
9418
3700
585
4950
2625
其它
3078
1035
1410
375
资料来源：见表1
（三） 价格及销售渠道的差异
由于国家逐步放开棉花收购市场，棉花销售正由指令性的计划方式开始逐步转向指导性的市场调节。因河北省棉麻公司的改革很微弱，使得其继续垄断着皮棉交易，所以皮棉市场销售份额很小。在山东表现却不同，皮棉市场结构多样化。
在皮棉和籽棉收购价上，调查中的各个品种基本一致。抗虫棉和常规棉的籽棉价和皮棉价都分别在3.3元/公斤左右和8.4元/公斤左右。棉麻公司的收购价格主要是依据棉花的出绒率、色泽等指标确定，棉花价格并没有表现出在品种上的明显差异。但是由于一些抗虫棉的棉籽（33B等）被种子公司回收，所以价格稍高些，这也使得Bt抗虫棉的籽棉价格稍高于其他棉花品种。
（四） 经济效益评价差异
